Die Bioinformatik befasst sich mit einer rasch ansteigenden Flut von Daten, für deren effiziente Analyse und Nutzung (Data Mining) sie verschiedene Genomik-Datenbanken erstellt und integriert. Hochdurchsatz-Sequenzanalysen und Vergleiche grösserer Genome erfordern eine erweiterte und gut integrierte Reihe leistungsfähiger Sequenzanalyse- und Modellierungsmethoden, Datenbankverwaltungssysteme und graphische interaktive Anzeige-Tools für die teilautomatisierte Verarbeitung riesiger Genomik-Datenmengen.

Neben der Genomikanalyse befasst sich die Bioinformatik auch noch mit verschiedenen anderen Bereichen. Für die Genexpressionsanalyse wurden Tools entwickelt, die es erlauben, Chip-Experimente mit Hilfe eines kontrollierten Vokabulars zu kommentieren und anhand einer Reihe von statistischen Methoden zu analysieren sowie die Genexpressionsergebnisse auf Stoffwechsel- und Signalwege zu projizieren, Genexpressionsmuster zu klassifizieren und die umfangreiche Menge der Genexpressionsdaten zu nutzen, die Roche zur Verfügung stehen. Diese Tools sind dicht integriert mit den Datenbanken und Tools der Genomanalyse.